L'ulcère le plus répandu est l'ulcère gastro-duodénal, qui touche le duodénum (première partie de l'intestin grêle, à la sortie de l'intestin) ou l'estomac. Le symptôme principal est la douleur, calmée par l'arrivée d'aliments. Ses causes ont longtemps été mystérieuses, et l'on pensait que son apparition était favorisée par le stress. En fait, on sait auj. que la principale cause des ulcères gastro-duodénaux est l'infection par une bactérie, Helicobacter pylori, découverte en 1982. Après recherche de cette bactérie, le traitement se fonde sur des antibiotiques destinés à l'éliminer.